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中国科学院南海海洋研究所成立于1959年1月，所址广州，是我国规模最大的综合性海洋研究机构之一，为中国科学院知识创新工程序列单位。现有职工590人，研究员79人，博士生导师86人，国家杰出青年基金获得者7名，国家“青年千人计划”2名，973首席科学家3人，中科院“百人计划”24人。拥有海洋科学博士后流动站，在站博士后30人。
设有热带海洋环境国家重点实验室、中科院边缘海地质重点实验室、中科院海洋生物资源可持续利用重点实验室、中科院海洋微生物研究中心、广东省海洋药物重点实验室、广东省应用海洋生物学重点实验室、深海观测开放实验室和南海深海过程联合实验室。 拥有大亚湾海洋生物综合实验站（国家野外试验站和中国生态系统研究网络“CERN”站）、海南热带海洋生物实验站（国家野外试验站和中国生态系统研究网络“CERN”站）、湛江海洋经济动物实验站、汕头海洋植物实验站和西沙、南沙深海海洋环境观测研究站；有“实验1”号、“实验2”号和“实验3”号三艘大型海洋科学考察船；以及南海海洋生物标本馆和海洋信息服务中心。
2012年，被批准为海洋科学、环境科学与工程两个一级学科博士学位授予单位。招生专业为物理海洋学、海洋化学、海洋生物学、海洋地质、环境科学和水产养殖。专业学位硕士研究生招生专业有环境工程、生物工程和地质工程。 现有在学研究生299人，其中博士研究生133人，硕士研究生166人。生活条件和学习环境优越，助学金及研究津贴优厚。热忱欢迎有志于海洋科学研究事业的青年学子报考。
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